La presqu'île de Scandola est caractérisée par des falaises rocheuses qui outre leur intérêt géologique (caldeira, orgues rhyolithiques en position horizontal) abritent de nombreux oiseaux marins et est un site important pour la reproduction du balbuzard pêcheur, cormoran huppé méditerranéen et dans une moindre mesure puffin cendré (aucune nichée à terme à cause du rat) et faucon pèlerin.

De nombreuses espèces végétales endémiques : 38 espèces dont 17 ont le statut d'espèce protégée sont présentes sur territoire de la Réserve. La partie terrestre de la Réserve abrite 16 habitats élémentaires.

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